L’arrêt Vaudagne, situé entre Servoz et Viaduc-Sainte-Marie, avait été fermé au début des années 1990. Il a rouvert en juillet 2008. Le quai a été refait ; un nouvel abri a été installé.
Un nouvel arrêt a été créé entre Chamonix et les Moussoux. Il est situé en centre-ville de Chamonix, à l’intersection de l’avenue de l’Aiguille du Midi et de la rue Paccard. Il est opportunément dénommé Chamonix-Aiguille du Midi. Un quai accessible a été créé ; il est muni d’un abri en verre. Il a ouvert début juillet 2009.
Deux rames Z 870 ont été livrées au Martigny-Châtelard en juin 2011. Elles sont directement dérivées des Z 850, mais contrairement à ces dernières, elles disposent de tous les dispositifs pour circuler en Suisse, notamment en ce qui concerne la section à crémaillère. Après une importante campagne d’essais, elles sont entrées en service commercial en janvier 2012.
Une rénovation importante de la ligne va avoir lieu en 2012-2013, dans l’objectif de faire passer le trafic à deux trains par heure dans chaque sens de circulation. Les opérations comprennent un renouvellement partiel de la voie, l’installation d’une nouvelle signalisation (block automatique lumineux), l’implantation de deux nouvelles sous-stations électriques, ainsi que la rénovation du tunnel des Montets.
Cette dernière inclut une réfection de la voie, qui sera encastrée dans une chaussée accessible en voiture lorsque le tunnel sert au désenclavement de la vallée de Vallorcine. De plus, la sécurité des circulations automobiles dans le tunnel devrait largement être améliorée.
Malgré un dépassement des coûts par rapport au chiffrage initial, les travaux ont commencé debut avril 2012 : la base travaux du tunnel des Montets a été installée fin mars à Montroc. De fait, la ligne sera être fermée pour six mois entre Chamonix et Vallorcine d’avril à octobre 2012. Une fermeture d’ampleur similaire aura lieu en 2013.